Metabolitler, tüm canlı organizmaların temel bileşenleridir; amino asitler, lipidler, organik asitler ve çevresel kimyasallar gibi oldukça çeşitli bir grubu temsil ederler. Vücudumuzdaki binlerce metabolit; tükettiğimiz gıdalardan, mikrobiyotamızdan ve vücudumuzda süregelen sayısız kimyasal süreçten köken alır. Metabolit modellerindeki bozulmaların, organizmanın hayatta kalması üzerinde dramatik etkiler yaratabilen metabolik hastalıklara yol açtığı iyi bilinmektedir.

Bu nedenle, günümüz klinik kimyasında metabolitlerin ölçümü hayati bir önem taşır. Metabolit profillerinin metabolik bozuklukların taranmasında (klinik kimya uygulamaları) kullanılmasının yanı sıra, temel biyolojik süreçleri anlamak için hedefli veya hedeflenmemiş profilleme çalışmaları gereklidir. Metabolitler, transkript verilerine kıyasla fenotipe daha yakın "uç noktalar" olarak kabul edildikleri için, doğrudan belirli fenotiplerle ilişkilendirilebilen biyokimyasal bilgiler sağlarlar. Bu bağlantılar; hedeflenen biyolojik süreçlerin keşfinde gen, protein veya diğer meta-verilerle ilişki kurmak ya da yeni biyobelirteçler tanımlamak amacıyla kullanılır.

Metabolomik, biyolojik sıvılarda ve dokularda bulunan küçük moleküllerin tespit edilmesi ve miktarlarının ölçülmesidir. LC-MS global metabolomik platformumuz, biyolojik sistemin mevcut durumuna yüksek doğrulukta ve tutarlı sonuçlar sağlayan analizler sunar. Bu sayede farmakodinamik, etkinlik ve yanıt biyobelirteçlerinin belirlenmesine ve temel biyolojik yol haritalarındaki değişimlerin açığa çıkarılmasına yardımcı olur.

LC-MS teknolojisi, bir karışım içindeki bileşenlerin önce UHPLC ile ayrıştırılmasını, ardından iyonlaştırılarak kütle/yük (m/z) oranlarına göre analiz edilmesini kapsar. Metabolomik testlerimizde LC-MS/MS tabanlı Orbitrap teknolojisi kullanılmaktadır.

• Literatür tabanlı protokollerle metabolomik analizlere uygun örnek hazırlığı
• UHPLC tabanlı ayırma sonrası LC-MS/MS Orbitrap teknolojisi ile ölçüm
• Ölçümlerin Thermo Scientific Orbitrap Exploris 240 MS sistemi ile gerçekleştirilmesi
• Metabolit tanımlama ve anotasyon için Compound Discoverer yazılımının kullanımı
• Verilerin uygun veri tabanları ve Compound Discoverer 3.3 aracılığıyla işlenmesi
• Analiz sonuçları yaklaşık 2 ila 3 hafta içinde teslim edilmektedir.

Örnekleriniz Phenome Omics’e ulaştığında, öncelikle gereksinimlerimizi karşılayıp karşılamadığını değerlendirmek amacıyla bir kabul kontrolü gerçekleştirilir. Bu aşamayı geçemeyen örnekler için sizinle iletişime geçilerek olası seçenekler görüşülür. Kabul kontrolünü geçen örnekler, hazırlık ve analiz sürecine alınır.

Laboratuvarımızda örnek hazırlama, metabolit tanımlama ve global metabolomik veri analizi süreçleri en son teknolojiye sahip sistemlerle yürütülmektedir. Temel hedefimiz, sadece birkaç mikrolitrelik örnek materyalinden mümkün olan en kapsamlı metabolik bilgiyi elde etmektir.

Hedeflenmemiş metabolomik analizlerde Thermo Scientific Orbitrap Exploris 240 MS sistemi kullanılmaktadır.

Bu ileri teknoloji platformu, belirtilen teknik avantajları sunar:

• Olağanüstü kütle doğruluğu
• 240.000’e varan ultra yüksek çözünürlük
• Düzenli ve hassas iyon yakalama
• m/z 40’a kadar genişletilmiş düşük kütle aralığı
• Dayanıklı ve yüksek cihaz performansı
• AcquireX akıllı veri toplama teknolojisi

Bu altyapı sayesinde, özellikle düşük bollukta bulunan bileşenler AcquireX Deep Scan yaklaşımı ile yüksek hassasiyetle tespit edilebilir.

Kütle spektrometrisinden elde edilen metabolomik veriler, Compound Discoverer 3.3 yazılımı kullanılarak analiz edilir. Gelişmiş veri tabanları ve spektral kütüphanelerle entegre çalışan bu yazılım sayesinde; özellik tespiti, veri sadeleştirme, bilinmeyen bileşenlerin tanımlanması, istatistiksel analizler ve metabolik yol haritalama süreçleri güvenilir ve etkin bir şekilde gerçekleştirilir.

Metabolomik testleri; hastalık durumunda bozulan, diyet, beslenme ve yaşam tarzı müdahaleleriyle düzeltilebilen geniş bir fizyolojik süreç yelpazesine ışık tutar.

Bilimsel çalışmalar, belirli metabolit düzeylerindeki değişimlerin çeşitli hastalıklarla doğrudan ilişkili olduğunu göstermektedir. Metabolit analizi sayesinde, hastalıklar henüz ortaya çıkmadan önlem alınması mümkündür.

Elde edilen sonuçlar doğrultusunda; kandaki metabolit düzeylerindeki artış veya azalışlara bağlı olarak beslenme düzeni, egzersiz alışkanlıkları ve stres yönetimi gibi yaşam tarzı alanlarında uygulanabilir ve kişiye özgü öneriler sunulabilir.