Tüm Transkriptom Dizilemesi
Prokaryotik ve ökaryotik örnekler için total RNA dizileme
Hizmet Özeti
- QIAsymphony PaxGene Blood RNA Kit kullanılarak QIAsymphony* sistemi ile RNA ekstraksiyonu
- Invitrogen Qubit, Agilent Bioanalyzer ve TapeStation sistemleri ile kalite kontrol
- Illumina kitleri ile kütüphane hazırlığı ve örnek indeksleme
- Hamilton NGS STAR platformu ile tam otomatik kütüphane hazırlığı
- NovaSeq 6000 sistemi ile dizileme (örnek başına ≥25 milyon okuma; toplam ≥50 milyon okuma)
- Analiz sonuçları yaklaşık 4 ila 5 hafta içinde teslim edilmektedir.**
- * Ekstraksiyonu yapılmamış örnekler için.
- ** İşlem süreleri garanti edilmez; proje kapsamına göre değişiklik gösterebilir.
Örnek Gereksinimleri
Kabul Edilen Örnek Türü
Önerilen Miktar
Gönderim Yöntemi
Tam Kan (Taze veya Donmuş)
PaxGene tüp: 2.5 mL /
2 mL tüp: 650 μL – 1 mL
≤3 gün oda sıcaklığı,
≥3 gün kuru buz
Doku
30 - 50 mg
Kuru buz
FFPE Doku
- 10 μm: 4–6 kesit
- 5 μm: 8–10 kesit
Oda sıcaklığı
Hücre Peleti
- ≥10^6 hücre (ökaryot)
- ≥10^8 hücre (mikroorganizma)
Kuru buz
Total RNA
50μl, >30 ng/μLRIN ≥7.0
Kuru buz
Örnek Kalitesinin Değerlendirilmesi
Örnekleriniz laboratuvarımıza ulaştığında kabul ve kalite kontrollerinden geçirilir.
Bununla birlikte, örnek gönderimi öncesinde kullanıcılarımızın kendi kalite kontrol (QC) değerlendirmelerini yapmaları önemle tavsiye edilir.
Konsantrasyon
Konsantrasyon ölçümlerinde florometrik yöntemlerin (Qubit, Quant-iT) kullanılması önerilir.
Minimum 100 ng RNA önerilmekle birlikte, protokol 1–1000 ng RNA aralığını desteklemektedir.
Düşük kaliteli RNA (RIN ≥2) veya FFPE örnekler (DV200 >55%) için 10–100 ng RNA ile optimize edilmiş iş akışları uygulanmaktadır.
Absorbans temelli ölçümler (Nanodrop, spektrofotometre) kullanılmamalıdır.
RNA Kalitesi
RNA kalitesi kapiler elektroforez tabanlı sistemler (Fragment Analyzer, Bioanalyzer, TapeStation) kullanılarak değerlendirilir ve ideal olarak RIN ≥7.0 olmalıdır. Agaroz jel elektroforezi önerilmemektedir. FFPE örnekler için DV200 değeri kapiler elektroforez ile belirlenmelidir.
Belirtilen kalite kriterlerinin altında kalan örnekler için, lütfen örnek gönderimi öncesinde bizimle iletişime geçiniz.
Örneklerin İşlenme Süreci
Örnekler Phenome Omics’e ulaştığında öncelikle bir kabul kontrolünden geçirilir ve belirlenen gereksinimleri karşılayıp karşılamadığı değerlendirilir.
Bu aşamada kriterleri karşılamayan örnekler için sizinle iletişime geçilerek olası seçenekler paylaşılır.
Kriterleri karşılamayan örneklerle devam edilmesi tercih edilirse, bu durum tamamen kullanıcı sorumluluğundadır.
Phenome Omics, kütüphane hazırlığı için yalnızca tek bir deneme yapmaktadır. Hazırlık sürecinin başarısız olması durumunda, kütüphane hazırlık ücreti yine tarafınızdan tahsil edilir.
Kabul kontrolünü geçen örnekler için bilgilendirme yapılır ve kütüphane hazırlık sürecine alınır.
Kütüphane Hazırlığı
Illumina Ribo-Zero Plus depletion kiti kullanılarak, ribozomal RNA (rRNA) ve globin RNA’ların uzaklaştırılmasına dayalı kütüphane hazırlama süreci uygulanmaktadır. Bu yaklaşım, düşük miktarda RNA içeren örneklerle de uyumlu olacak şekilde optimize edilmiştir. Ribozomal deplesyon temelli total RNA dizileme; mRNA’lar, polyadenilasyon yapmamış protein kodlamayan RNA’lar ve henüz eklenmemiş transkriptler dahil olmak üzere, küçük RNA’lar hariç tüm transkriptomu kapsayan kapsamlı bir analiz imkânı sunar.
Hazırlanan kütüphanelerin konsantrasyonu qPCR ile değerlendirilir ve fragment boyut dağılımı Bioanalyzer ile incelenir. QC adımını geçen kütüphaneler normalize edilir, havuzlanır ve dizileme sürecine alınır.
Hakkımızda
Araştırmalar & Yayınlar
Ödüller
Omics Kütüphanesi
Dil
Türkçe
Bize Ulaşın
Tüm Transkriptom Dizilemesi
Prokaryotik ve ökaryotik örnekler için total RNA dizileme
Hizmet Özeti
- QIAsymphony PaxGene Blood RNA Kit kullanılarak QIAsymphony* sistemi ile RNA ekstraksiyonu
- Invitrogen Qubit, Agilent Bioanalyzer ve TapeStation sistemleri ile kalite kontrol
- Illumina kitleri ile kütüphane hazırlığı ve örnek indeksleme
- Hamilton NGS STAR platformu ile tam otomatik kütüphane hazırlığı
- NovaSeq 6000 sistemi ile dizileme (örnek başına ≥25 milyon okuma; toplam ≥50 milyon okuma)
- Analiz sonuçları yaklaşık 4 ila 5 hafta içinde teslim edilmektedir.**
- * Ekstraksiyonu yapılmamış örnekler için.
- ** İşlem süreleri garanti edilmez; proje kapsamına göre değişiklik gösterebilir.
Örnek Gereksinimleri
Kabul Edilen Örnek Türü
Önerilen Miktar
Gönderim Yöntemi
Tam Kan (Taze veya Donmuş)
PaxGene tüp: 2.5 mL /
2 mL tüp: 650 μL – 1 mL
≤3 gün oda sıcaklığı,
≥3 gün kuru buz
Doku
30 - 50 mg
Kuru buz
FFPE Doku
- 10 μm: 4–6 kesit
- 5 μm: 8–10 kesit
Oda sıcaklığı
Hücre Peleti
- ≥10^6 hücre (ökaryot)
- ≥10^8 hücre (mikroorganizma)
Kuru buz
Total RNA
50μl, >30 ng/μLRIN ≥7.0
Kuru buz
Örnek Kalitesinin Değerlendirilmesi
Örnekleriniz laboratuvarımıza ulaştığında kabul ve kalite kontrollerinden geçirilir.
Bununla birlikte, örnek gönderimi öncesinde kullanıcılarımızın kendi kalite kontrol (QC) değerlendirmelerini yapmaları önemle tavsiye edilir.
Konsantrasyon
Konsantrasyon ölçümlerinde florometrik yöntemlerin (Qubit, Quant-iT) kullanılması önerilir.
Minimum 100 ng RNA önerilmekle birlikte, protokol 1–1000 ng RNA aralığını desteklemektedir.
Düşük kaliteli RNA (RIN ≥2) veya FFPE örnekler (DV200 >55%) için 10–100 ng RNA ile optimize edilmiş iş akışları uygulanmaktadır.
Absorbans temelli ölçümler (Nanodrop, spektrofotometre) kullanılmamalıdır.
RNA Kalitesi
RNA kalitesi kapiler elektroforez tabanlı sistemler (Fragment Analyzer, Bioanalyzer, TapeStation) kullanılarak değerlendirilir ve ideal olarak RIN ≥7.0 olmalıdır. Agaroz jel elektroforezi önerilmemektedir. FFPE örnekler için DV200 değeri kapiler elektroforez ile belirlenmelidir.
Belirtilen kalite kriterlerinin altında kalan örnekler için, lütfen örnek gönderimi öncesinde bizimle iletişime geçiniz.
Örneklerin İşlenme Süreci
Örnekler Phenome Omics’e ulaştığında öncelikle bir kabul kontrolünden geçirilir ve belirlenen gereksinimleri karşılayıp karşılamadığı değerlendirilir.
Bu aşamada kriterleri karşılamayan örnekler için sizinle iletişime geçilerek olası seçenekler paylaşılır.
Kriterleri karşılamayan örneklerle devam edilmesi tercih edilirse, bu durum tamamen kullanıcı sorumluluğundadır.
Phenome Omics, kütüphane hazırlığı için yalnızca tek bir deneme yapmaktadır. Hazırlık sürecinin başarısız olması durumunda, kütüphane hazırlık ücreti yine tarafınızdan tahsil edilir.
Kabul kontrolünü geçen örnekler için bilgilendirme yapılır ve kütüphane hazırlık sürecine alınır.
Kütüphane Hazırlığı
Illumina Ribo-Zero Plus depletion kiti kullanılarak, ribozomal RNA (rRNA) ve globin RNA’ların uzaklaştırılmasına dayalı kütüphane hazırlama süreci uygulanmaktadır. Bu yaklaşım, düşük miktarda RNA içeren örneklerle de uyumlu olacak şekilde optimize edilmiştir. Ribozomal deplesyon temelli total RNA dizileme; mRNA’lar, polyadenilasyon yapmamış protein kodlamayan RNA’lar ve henüz eklenmemiş transkriptler dahil olmak üzere, küçük RNA’lar hariç tüm transkriptomu kapsayan kapsamlı bir analiz imkânı sunar.
Hazırlanan kütüphanelerin konsantrasyonu qPCR ile değerlendirilir ve fragment boyut dağılımı Bioanalyzer ile incelenir. QC adımını geçen kütüphaneler normalize edilir, havuzlanır ve dizileme sürecine alınır.
Hakkımızda
Araştırmalar & Yayınlar
Ödüller
Omics Kütüphanesi
Dil
Türkçe
Bize Ulaşın
Phenome Omics © 2026
Tüm Transkriptom Dizilemesi
Prokaryotik ve ökaryotik örnekler için total RNA dizileme
Hizmet Özeti
- QIAsymphony PaxGene Blood RNA Kit kullanılarak QIAsymphony* sistemi ile RNA ekstraksiyonu
- Invitrogen Qubit, Agilent Bioanalyzer ve TapeStation sistemleri ile kalite kontrol
- Illumina kitleri ile kütüphane hazırlığı ve örnek indeksleme
- Hamilton NGS STAR platformu ile tam otomatik kütüphane hazırlığı
- NovaSeq 6000 sistemi ile dizileme (örnek başına ≥25 milyon okuma; toplam ≥50 milyon okuma)
- Analiz sonuçları yaklaşık 4 ila 5 hafta içinde teslim edilmektedir.**
- * Ekstraksiyonu yapılmamış örnekler için.
- ** İşlem süreleri garanti edilmez; proje kapsamına göre değişiklik gösterebilir.
Örnek Gereksinimleri
Kabul Edilen Örnek Türü
Önerilen Miktar
Gönderim Yöntemi
Tam Kan (Taze veya Donmuş)
PaxGene tüp: 2.5 mL /
2 mL tüp: 650 μL – 1 mL
≤3 gün oda sıcaklığı,
≥3 gün kuru buz
Doku
30 - 50 mg
Kuru buz
FFPE Doku
- 10 μm: 4–6 kesit
- 5 μm: 8–10 kesit
Oda sıcaklığı
Hücre Peleti
- ≥10^6 hücre (ökaryot)
- ≥10^8 hücre (mikroorganizma)
Kuru buz
Total RNA
50μl, >30 ng/μLRIN ≥7.0
Kuru buz
Örnek Kalitesinin Değerlendirilmesi
Örnekleriniz laboratuvarımıza ulaştığında kabul ve kalite kontrollerinden geçirilir.
Bununla birlikte, örnek gönderimi öncesinde kullanıcılarımızın kendi kalite kontrol (QC) değerlendirmelerini yapmaları önemle tavsiye edilir.
Konsantrasyon
Konsantrasyon ölçümlerinde florometrik yöntemlerin (Qubit, Quant-iT) kullanılması önerilir.
Minimum 100 ng RNA önerilmekle birlikte, protokol 1–1000 ng RNA aralığını desteklemektedir.
Düşük kaliteli RNA (RIN ≥2) veya FFPE örnekler (DV200 >55%) için 10–100 ng RNA ile optimize edilmiş iş akışları uygulanmaktadır.
Absorbans temelli ölçümler (Nanodrop, spektrofotometre) kullanılmamalıdır.
RNA Kalitesi
RNA kalitesi kapiler elektroforez tabanlı sistemler (Fragment Analyzer, Bioanalyzer, TapeStation) kullanılarak değerlendirilir ve ideal olarak RIN ≥7.0 olmalıdır. Agaroz jel elektroforezi önerilmemektedir. FFPE örnekler için DV200 değeri kapiler elektroforez ile belirlenmelidir.
Belirtilen kalite kriterlerinin altında kalan örnekler için, lütfen örnek gönderimi öncesinde bizimle iletişime geçiniz.
Örneklerin İşlenme Süreci
Örnekler Phenome Omics’e ulaştığında öncelikle bir kabul kontrolünden geçirilir ve belirlenen gereksinimleri karşılayıp karşılamadığı değerlendirilir.
Bu aşamada kriterleri karşılamayan örnekler için sizinle iletişime geçilerek olası seçenekler paylaşılır.
Kriterleri karşılamayan örneklerle devam edilmesi tercih edilirse, bu durum tamamen kullanıcı sorumluluğundadır.
Phenome Omics, kütüphane hazırlığı için yalnızca tek bir deneme yapmaktadır. Hazırlık sürecinin başarısız olması durumunda, kütüphane hazırlık ücreti yine tarafınızdan tahsil edilir.
Kabul kontrolünü geçen örnekler için bilgilendirme yapılır ve kütüphane hazırlık sürecine alınır.
Kütüphane Hazırlığı
Illumina Ribo-Zero Plus depletion kiti kullanılarak, ribozomal RNA (rRNA) ve globin RNA’ların uzaklaştırılmasına dayalı kütüphane hazırlama süreci uygulanmaktadır. Bu yaklaşım, düşük miktarda RNA içeren örneklerle de uyumlu olacak şekilde optimize edilmiştir. Ribozomal deplesyon temelli total RNA dizileme; mRNA’lar, polyadenilasyon yapmamış protein kodlamayan RNA’lar ve henüz eklenmemiş transkriptler dahil olmak üzere, küçük RNA’lar hariç tüm transkriptomu kapsayan kapsamlı bir analiz imkânı sunar.
Hazırlanan kütüphanelerin konsantrasyonu qPCR ile değerlendirilir ve fragment boyut dağılımı Bioanalyzer ile incelenir. QC adımını geçen kütüphaneler normalize edilir, havuzlanır ve dizileme sürecine alınır.
Hakkımızda
Araştırmalar & Yayınlar
Ödüller
Omics Kütüphanesi
Dil
Türkçe
Bize Ulaşın
Phenome Omics © 2026